API Reference

• cycquery
  • cycquery.interface
    • cycquery.interface.QueryInterface
      • QueryInterface
        • QueryInterface.__init__()
        • QueryInterface.clear_data()
        • QueryInterface.data
        • QueryInterface.join()
        • QueryInterface.ops()
        • QueryInterface.run()
        • QueryInterface.save()
        • QueryInterface.union()
        • QueryInterface.union_all()
  • cycquery.ops
    • cycquery.ops.AddColumn
      • AddColumn
        • AddColumn.__call__()
        • AddColumn.__init__()
    • cycquery.ops.AddDeltaColumn
      • AddDeltaColumn
        • AddDeltaColumn.__call__()
        • AddDeltaColumn.__init__()
    • cycquery.ops.AddDeltaConstant
      • AddDeltaConstant
        • AddDeltaConstant.__call__()
        • AddDeltaConstant.__init__()
    • cycquery.ops.AddNumeric
      • AddNumeric
        • AddNumeric.__call__()
        • AddNumeric.__init__()
    • cycquery.ops.And
      • And
        • And.__call__()
        • And.__init__()
    • cycquery.ops.Apply
      • Apply
        • Apply.__call__()
        • Apply.__init__()
    • cycquery.ops.Cast
      • Cast
        • Cast.__call__()
        • Cast.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionAfterDate
      • ConditionAfterDate
        • ConditionAfterDate.__call__()
        • ConditionAfterDate.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionBeforeDate
      • ConditionBeforeDate
        • ConditionBeforeDate.__call__()
        • ConditionBeforeDate.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionEndsWith
      • ConditionEndsWith
        • ConditionEndsWith.__call__()
        • ConditionEndsWith.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionEquals
      • ConditionEquals
        • ConditionEquals.__call__()
        • ConditionEquals.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionGreaterThan
      • ConditionGreaterThan
        • ConditionGreaterThan.__call__()
        • ConditionGreaterThan.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionIn
      • ConditionIn
        • ConditionIn.__call__()
        • ConditionIn.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionInMonths
      • ConditionInMonths
        • ConditionInMonths.__call__()
        • ConditionInMonths.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionInYears
      • ConditionInYears
        • ConditionInYears.__call__()
        • ConditionInYears.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionLessThan
      • ConditionLessThan
        • ConditionLessThan.__call__()
        • ConditionLessThan.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionLike
      • ConditionLike
        • ConditionLike.__call__()
        • ConditionLike.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionRegexMatch
      • ConditionRegexMatch
        • ConditionRegexMatch.__call__()
        • ConditionRegexMatch.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionStartsWith
      • ConditionStartsWith
        • ConditionStartsWith.__call__()
        • ConditionStartsWith.__init__()
    • cycquery.ops.ConditionSubstring
      • ConditionSubstring
        • ConditionSubstring.__call__()
        • ConditionSubstring.__init__()
    • cycquery.ops.Count
      • Count
        • Count.__call__()
        • Count.__init__()
    • cycquery.ops.Distinct
      • Distinct
        • Distinct.__call__()
        • Distinct.__init__()
    • cycquery.ops.Drop
      • Drop
        • Drop.__call__()
        • Drop.__init__()
    • cycquery.ops.DropEmpty
      • DropEmpty
        • DropEmpty.__call__()
        • DropEmpty.__init__()
    • cycquery.ops.DropNulls
      • DropNulls
        • DropNulls.__call__()
        • DropNulls.__init__()
    • cycquery.ops.ExtractTimestampComponent
      • ExtractTimestampComponent
        • ExtractTimestampComponent.__call__()
        • ExtractTimestampComponent.__init__()
    • cycquery.ops.FillNull
      • FillNull
        • FillNull.__call__()
        • FillNull.__init__()
    • cycquery.ops.GroupByAggregate
      • GroupByAggregate
        • GroupByAggregate.__call__()
        • GroupByAggregate.__init__()
    • cycquery.ops.Join
      • Join
        • Join.__call__()
        • Join.__init__()
    • cycquery.ops.Keep
      • Keep
        • Keep.__call__()
        • Keep.__init__()
    • cycquery.ops.Limit
      • Limit
        • Limit.__call__()
        • Limit.__init__()
    • cycquery.ops.Literal
      • Literal
        • Literal.__call__()
        • Literal.__init__()
    • cycquery.ops.Or
      • Or
        • Or.__call__()
        • Or.__init__()
    • cycquery.ops.OrderBy
      • OrderBy
        • OrderBy.__call__()
        • OrderBy.__init__()
    • cycquery.ops.QueryOp
      • QueryOp
        • QueryOp.__call__()
        • QueryOp.__init__()
    • cycquery.ops.RandomizeOrder
      • RandomizeOrder
        • RandomizeOrder.__call__()
        • RandomizeOrder.__init__()
    • cycquery.ops.Rename
      • Rename
        • Rename.__call__()
        • Rename.__init__()
    • cycquery.ops.Reorder
      • Reorder
        • Reorder.__call__()
        • Reorder.__init__()
    • cycquery.ops.ReorderAfter
      • ReorderAfter
        • ReorderAfter.__call__()
        • ReorderAfter.__init__()
    • cycquery.ops.Sequential
      • Sequential
        • Sequential.__add__()
        • Sequential.__call__()
        • Sequential.__init__()
        • Sequential.append()
        • Sequential.extend()
        • Sequential.insert()
        • Sequential.pop()
    • cycquery.ops.Substring
      • Substring
        • Substring.__call__()
        • Substring.__init__()
    • cycquery.ops.Trim
      • Trim
        • Trim.__call__()
        • Trim.__init__()
    • cycquery.ops.Union
      • Union
        • Union.__call__()
        • Union.__init__()
  • cycquery.base
    • cycquery.base.DatasetQuerier
      • DatasetQuerier
        • DatasetQuerier.db
        • DatasetQuerier.__init__()
        • DatasetQuerier.get_table()
        • DatasetQuerier.list_columns()
        • DatasetQuerier.list_custom_tables()
        • DatasetQuerier.list_schemas()
        • DatasetQuerier.list_tables()
  • dataset APIs
    • cycquery.mimiciii
      • cycquery.mimiciii.MIMICIIIQuerier
        • MIMICIIIQuerier
          • MIMICIIIQuerier.__init__()
          • MIMICIIIQuerier.chartevents()
          • MIMICIIIQuerier.diagnoses()
          • MIMICIIIQuerier.get_table()
          • MIMICIIIQuerier.labevents()
          • MIMICIIIQuerier.list_columns()
          • MIMICIIIQuerier.list_custom_tables()
          • MIMICIIIQuerier.list_schemas()
          • MIMICIIIQuerier.list_tables()
    • cycquery.mimiciv
      • cycquery.mimiciv.MIMICIVQuerier
        • MIMICIVQuerier
          • MIMICIVQuerier.__init__()
          • MIMICIVQuerier.chartevents()
          • MIMICIVQuerier.diagnoses_icd()
          • MIMICIVQuerier.get_table()
          • MIMICIVQuerier.labevents()
          • MIMICIVQuerier.list_columns()
          • MIMICIVQuerier.list_custom_tables()
          • MIMICIVQuerier.list_schemas()
          • MIMICIVQuerier.list_tables()
          • MIMICIVQuerier.patients()
          • MIMICIVQuerier.procedures_icd()
    • cycquery.eicu
      • cycquery.eicu.EICUQuerier
        • EICUQuerier
          • EICUQuerier.__init__()
          • EICUQuerier.get_table()
          • EICUQuerier.list_columns()
          • EICUQuerier.list_custom_tables()
          • EICUQuerier.list_schemas()
          • EICUQuerier.list_tables()
    • cycquery.omop
      • cycquery.omop.OMOPQuerier
        • OMOPQuerier
          • OMOPQuerier.__init__()
          • OMOPQuerier.get_table()
          • OMOPQuerier.list_columns()
          • OMOPQuerier.list_custom_tables()
          • OMOPQuerier.list_schemas()
          • OMOPQuerier.list_tables()
          • OMOPQuerier.map_concept_ids_to_name()
          • OMOPQuerier.measurement()
          • OMOPQuerier.observation()
          • OMOPQuerier.person()
          • OMOPQuerier.visit_detail()
          • OMOPQuerier.visit_occurrence()
    • cycquery.gemini
      • cycquery.gemini.GEMINIQuerier
        • GEMINIQuerier
          • GEMINIQuerier.__init__()
          • GEMINIQuerier.care_units()
          • GEMINIQuerier.diagnoses()
          • GEMINIQuerier.get_table()
          • GEMINIQuerier.imaging()
          • GEMINIQuerier.ip_admin()
          • GEMINIQuerier.list_columns()
          • GEMINIQuerier.list_custom_tables()
          • GEMINIQuerier.list_schemas()
          • GEMINIQuerier.list_tables()
          • GEMINIQuerier.room_transfer()